微生物快速鑒定的蛋白質(zhì)組學(xué)研究策略

微生物快速鑒定的蛋白質(zhì)組學(xué)研究策略
摘要
        我們已經(jīng)介紹了應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)的快速表征微生物（Demirev Anal.Chem等，1999）的戰(zhàn)略，我們已經(jīng)證明了運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)策略的獨(dú)特優(yōu)勢(shì)，以確定微生物混合物或污染樣品（Warscheid Fenselau，肛門(mén); 2003年）。水份儀| 分析儀| 溶氧計(jì)| 電導(dǎo)度計(jì)| PH計(jì)| 酸堿計(jì)| 糖度計(jì)| 鹽度計(jì)| 酸堿度計(jì)| 電導(dǎo)計(jì)| 水分測(cè)定儀| 濁度計(jì)|
蛋白質(zhì)組學(xué)策略的優(yōu)點(diǎn)包括，這是沒(méi)有必要的獲得重復(fù)性譜，分析是獨(dú)立的電離技術(shù)，它需要在世界各地正在開(kāi)發(fā)的生物信息學(xué)軟件的優(yōu)勢(shì)，并正在組裝原核生物和其他基因組/蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)自許多實(shí)驗(yàn)室的貢獻(xiàn)。我們的戰(zhàn)略包括混合分析溶在原地，這些蛋白質(zhì)裂解的蛋白質(zhì)數(shù)量有限的化學(xué)或酶制劑，鑒定和許多肽/蛋白質(zhì)或靶向肽肽，從而識(shí)別微生物，毒素和其他組件樣品中。質(zhì)量較低的肽離子在這一戰(zhàn)略進(jìn)行了分析，而不是蛋白質(zhì)，從而提供更高的靈敏度和質(zhì)量精確度較高。
最近，我們已經(jīng)證明，實(shí)施上使用離子阱質(zhì)譜儀，大氣壓力（AP）的MALDI質(zhì)譜，這有利于自動(dòng)化和實(shí)施有利于收購(gòu)的microsequences（Pribil，Doroshenko，等，2004年ASMS上）。的總體戰(zhàn)略，從我們的實(shí)驗(yàn)室的最新研究成果，并為的真實(shí)bioagents（如炭疽桿菌，鼠疫Yershinia，牛痘病毒和肉毒桿菌神經(jīng)毒素一）和雜亂的環(huán)境（如工業(yè)的影響，其中的數(shù)據(jù)將提交灰塵，自然細(xì)菌，花粉，胰蛋白酶抑制劑）對(duì)代理人的身份證明。